Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MED27Q6P2C8 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MED27Q6P2C8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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MED27Q6P2C8 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MED27Q6P2C8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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