Protein–RNA interactions for Protein: Q92963

RIT1, GTP-binding protein Rit1, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT1Q92963 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RIT1Q92963 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RIT1Q92963 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms