Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3R4

NEU2, Sialidase-2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU2Q9Y3R4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NEU2Q9Y3R4 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEU2Q9Y3R4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms