Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.646e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C11orf24-203ENST00000529339 603 ntTSL 218.97■□□□□ 0.632e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-212ENST00000602860 1858 ntTSL 518.95■□□□□ 0.621e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.626e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SKA3-204ENST00000462482 750 ntTSL 218.9■□□□□ 0.626e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LINC01029-201ENST00000577408 1249 nt18.64■□□□□ 0.573e-12■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 BSCL2-217ENST00000524862 865 ntTSL 518.41■□□□□ 0.546e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CMTM3-213ENST00000566756 1950 ntTSL 218.28■□□□□ 0.521e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PGP-202ENST00000562001 905 ntTSL 218.25■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LONP1-208ENST00000589473 793 ntTSL 318.25■□□□□ 0.511e-31■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.511e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-207ENST00000602622 2526 ntTSL 218.18■□□□□ 0.51e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRR1-203ENST00000540712 1597 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CERS2-208ENST00000460664 850 ntTSL 317.93■□□□□ 0.461e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 USP5-207ENST00000542371 768 ntTSL 217.92■□□□□ 0.466e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CERS2-211ENST00000559020 594 ntTSL 417.45■□□□□ 0.381e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.381e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COG8-203ENST00000564419 936 ntTSL 517.4■□□□□ 0.381e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.371e-31■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-203ENST00000406539 2274 ntTSL 217.26■□□□□ 0.356e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C11orf24-208ENST00000532969 485 ntTSL 217.18■□□□□ 0.342e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.341e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.326e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.311e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATP5A1-211ENST00000590156 1931 ntTSL 216.87■□□□□ 0.294e-26■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.285e-15■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COG8-207ENST00000562949 887 ntTSL 316.77■□□□□ 0.281e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SREBF1-207ENST00000447641 644 ntTSL 316.72■□□□□ 0.271e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LRCH4-202ENST00000467201 4754 ntTSL 216.67■□□□□ 0.261e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.246e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.246e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CERS2-204ENST00000368949 1002 ntTSL 516.47■□□□□ 0.231e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FANCA-226ENST00000567879 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.39■□□□□ 0.216e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LONP1-206ENST00000587552 2816 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-31■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ANKS6-206ENST00000486778 677 ntTSL 316.29■□□□□ 0.21e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.25e-15■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.184e-26■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.184e-26■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RPAP1-208ENST00000565167 1712 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.186e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ZNF275-203ENST00000438239 591 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 BSCL2-227ENST00000537604 691 ntTSL 316.05■□□□□ 0.166e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 MCM5-203ENST00000416905 739 ntTSL 316.04■□□□□ 0.166e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.151e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.122e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.12e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FADS3-203ENST00000525094 403 ntTSL 515.59■□□□□ 0.091e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COQ9-204ENST00000563166 399 ntTSL 515.51■□□□□ 0.072e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.051e-31■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.042e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 BSCL2-222ENST00000530900 398 ntTSL 315.27■□□□□ 0.046e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.016e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-208ENST00000602656 714 ntTSL 214.75□□□□□ -0.051e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ANKS6-207ENST00000634393 2284 ntTSL 514.63□□□□□ -0.071e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.076e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.076e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FANCA-208ENST00000561722 696 ntTSL 314.55□□□□□ -0.086e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SKA3-201ENST00000298260 2803 ntTSL 214.42□□□□□ -0.16e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ZMIZ1-202ENST00000446377 6686 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.121e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 JMJD6-207ENST00000591460 667 ntTSL 214.09□□□□□ -0.151e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FANCA-231ENST00000568626 727 ntTSL 314.04□□□□□ -0.166e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FANCA-209ENST00000562424 745 ntTSL 213.79□□□□□ -0.26e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FANCA-215ENST00000564475 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.79□□□□□ -0.26e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 POLR1B-201ENST00000263331 4558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.221e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PPP1R7-208ENST00000415769 514 ntTSL 213.63□□□□□ -0.231e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.246e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 E2F3-203ENST00000613242 4094 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.292e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SKA3-203ENST00000400018 2745 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.36e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 MCM5-206ENST00000451351 450 ntTSL 413.06□□□□□ -0.326e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 B4GALT1-201ENST00000379731 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RFC2-212ENST00000497430 753 ntTSL 313.01□□□□□ -0.331e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CEPT1-209ENST00000498239 1957 ntTSL 1 (best)12.92□□□□□ -0.346e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ACD-204ENST00000602382 662 ntTSL 512.82□□□□□ -0.361e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 POLR1B-202ENST00000333990 4376 ntTSL 1 (best)12.76□□□□□ -0.371e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RPAP1-201ENST00000304330 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.376e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FANCA-216ENST00000564870 460 ntTSL 312.7□□□□□ -0.386e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CEPT1-201ENST00000357172 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.386e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RPAP1-204ENST00000562303 5897 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.426e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PGLS-205ENST00000598811 869 ntTSL 1 (best)12.4□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RNF169-202ENST00000527301 340 ntTSL 312.39□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PPP1R7-213ENST00000450367 1030 ntTSL 512.35□□□□□ -0.431e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 C17orf49-207ENST00000550038 363 ntTSL 312.13□□□□□ -0.472e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CEPT1-210ENST00000545121 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.476e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 DCAF13-208ENST00000612750 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 POLR1B-217ENST00000541869 5059 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.471e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 VPS11-208ENST00000621676 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.531e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.556e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 WARS-220ENST00000554950 1376 ntTSL 211.43□□□□□ -0.581e-13■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATP5A1-202ENST00000398752 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.584e-26■□□□□ 9.5
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