RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329970.7

GTF3C6-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF3C6, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6-201ENST00000329970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.94■■■■□ 3.02
GTF3C6-201ENST00000329970 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.48■■■□□ 2.47
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCC9O60706 1549 aa30.03■■■□□ 2.4
GTF3C6-201ENST00000329970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.83■■■□□ 2.21
GTF3C6-201ENST00000329970 NACADO15069 1562 aa28.71■■■□□ 2.19
GTF3C6-201ENST00000329970 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.46■■■□□ 2.15
GTF3C6-201ENST00000329970 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.28■■■□□ 2.12
GTF3C6-201ENST00000329970 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.23■■■□□ 2.11
GTF3C6-201ENST00000329970 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
GTF3C6-201ENST00000329970 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.15■■■□□ 2.1
GTF3C6-201ENST00000329970 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.96■■■□□ 2.07
GTF3C6-201ENST00000329970 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.93■■■□□ 2.06
GTF3C6-201ENST00000329970 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
GTF3C6-201ENST00000329970 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.73■■■□□ 2.03
GTF3C6-201ENST00000329970 SCRIBQ14160 1630 aa27.61■■■□□ 2.01
GTF3C6-201ENST00000329970 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
GTF3C6-201ENST00000329970 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.24■■□□□ 1.95
GTF3C6-201ENST00000329970 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.08■■□□□ 1.93
GTF3C6-201ENST00000329970 NCAPD3P42695 1498 aa26.46■■□□□ 1.83
GTF3C6-201ENST00000329970 SMARCA4P51532 1647 aa26.44■■□□□ 1.82
GTF3C6-201ENST00000329970 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.38■■□□□ 1.81
GTF3C6-201ENST00000329970 SMARCA2P51531 1590 aa26.37■■□□□ 1.81
GTF3C6-201ENST00000329970 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
GTF3C6-201ENST00000329970 HMGXB3Q12766 1538 aa26.34■■□□□ 1.81
GTF3C6-201ENST00000329970 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.26■■□□□ 1.79
GTF3C6-201ENST00000329970 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GTF3C6-201ENST00000329970 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.1■■□□□ 1.77
GTF3C6-201ENST00000329970 CUX2O14529 1486 aa25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6-201ENST00000329970 ERCC6Q03468 1493 aa25.93■■□□□ 1.74
GTF3C6-201ENST00000329970 NESP48681 1621 aa25.88■■□□□ 1.73
GTF3C6-201ENST00000329970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.86■■□□□ 1.73
GTF3C6-201ENST00000329970 WIZO95785 1651 aa25.82■■□□□ 1.72
GTF3C6-201ENST00000329970 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
GTF3C6-201ENST00000329970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.65■■□□□ 1.7
GTF3C6-201ENST00000329970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.64■■□□□ 1.7
GTF3C6-201ENST00000329970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
GTF3C6-201ENST00000329970 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.62■■□□□ 1.69
GTF3C6-201ENST00000329970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.57■■□□□ 1.68
GTF3C6-201ENST00000329970 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
GTF3C6-201ENST00000329970 CFTRP13569 1480 aa25.41■■□□□ 1.66
GTF3C6-201ENST00000329970 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.4■■□□□ 1.66
GTF3C6-201ENST00000329970 WDR62O43379 1518 aa25.38■■□□□ 1.65
GTF3C6-201ENST00000329970 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.34■■□□□ 1.65
GTF3C6-201ENST00000329970 PRDM2Q13029 1718 aa25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6-201ENST00000329970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.32■■□□□ 1.64
GTF3C6-201ENST00000329970 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.19■■□□□ 1.62
GTF3C6-201ENST00000329970 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCC8Q09428 1581 aa24.91■■□□□ 1.58
GTF3C6-201ENST00000329970 TOPBP1Q92547 1522 aa24.89■■□□□ 1.57
GTF3C6-201ENST00000329970 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6-201ENST00000329970 IFT140Q96RY7 1462 aa24.85■■□□□ 1.57
GTF3C6-201ENST00000329970 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
GTF3C6-201ENST00000329970 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
GTF3C6-201ENST00000329970 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6-201ENST00000329970 OSCARQ8IYS5 282 aa24.67■■□□□ 1.54
GTF3C6-201ENST00000329970 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
GTF3C6-201ENST00000329970 WDR97A6NE52 1622 aa24.57■■□□□ 1.52
GTF3C6-201ENST00000329970 CUX1P39880 1505 aa24.52■■□□□ 1.52
GTF3C6-201ENST00000329970 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.512e-6■■■■■ 26.9
GTF3C6-201ENST00000329970 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.5■■□□□ 1.51
GTF3C6-201ENST00000329970 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6-201ENST00000329970 SOGA1O94964 1423 aa24.49■■□□□ 1.51
GTF3C6-201ENST00000329970 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.48■■□□□ 1.51
GTF3C6-201ENST00000329970 CHD1O14646 1710 aa24.47■■□□□ 1.51
GTF3C6-201ENST00000329970 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6-201ENST00000329970 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6-201ENST00000329970 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6-201ENST00000329970 TRIM41Q8WV44 630 aa24.39■■□□□ 1.49
GTF3C6-201ENST00000329970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
GTF3C6-201ENST00000329970 ARHGEF11O15085 1522 aa24.33■■□□□ 1.49
GTF3C6-201ENST00000329970 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
GTF3C6-201ENST00000329970 GRIN2BQ13224 1484 aa24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6-201ENST00000329970 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.3■■□□□ 1.48
GTF3C6-201ENST00000329970 PBRM1Q86U86 1689 aa24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.29■■□□□ 1.48
GTF3C6-201ENST00000329970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.28■■□□□ 1.48
GTF3C6-201ENST00000329970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.26■■□□□ 1.47
GTF3C6-201ENST00000329970 TOP2BQ02880 1626 aa24.25■■□□□ 1.47
GTF3C6-201ENST00000329970 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.23■■□□□ 1.47
GTF3C6-201ENST00000329970 SYNJ2O15056 1496 aa24.2■■□□□ 1.47
GTF3C6-201ENST00000329970 FBLN2P98095 1184 aa24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6-201ENST00000329970 SYNJ1O43426 1573 aa24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6-201ENST00000329970 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.2■■□□□ 1.46
GTF3C6-201ENST00000329970 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6-201ENST00000329970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6-201ENST00000329970 ARAP1Q96P48 1450 aa24.09■■□□□ 1.45
GTF3C6-201ENST00000329970 ADAMTS12P58397 1594 aa24.04■■□□□ 1.44
GTF3C6-201ENST00000329970 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.01■■□□□ 1.43
GTF3C6-201ENST00000329970 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24■■□□□ 1.43
GTF3C6-201ENST00000329970 GRIN2AQ12879 1464 aa23.99■■□□□ 1.43
GTF3C6-201ENST00000329970 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.94■■□□□ 1.42
GTF3C6-201ENST00000329970 NUP160Q12769 1436 aa23.93■■□□□ 1.42
GTF3C6-201ENST00000329970 CEP170Q5SW79 1584 aa23.9■■□□□ 1.42
GTF3C6-201ENST00000329970 SHROOM2Q13796 1616 aa23.85■■□□□ 1.41
GTF3C6-201ENST00000329970 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.74■■□□□ 1.39
GTF3C6-201ENST00000329970 CUL7Q14999 1698 aa23.73■■□□□ 1.39
GTF3C6-201ENST00000329970 KIF27Q86VH2 1401 aa23.71■■□□□ 1.39
GTF3C6-201ENST00000329970 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.7■■□□□ 1.38
GTF3C6-201ENST00000329970 IGF1RP08069 1367 aa23.65■■□□□ 1.38
GTF3C6-201ENST00000329970 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms