Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
EBAG9O00559 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms