RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355594.8

ANKRD35-201, Transcript of ankyrin repeat domain 35, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ANKRD35, Length 3,342 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35-201ENST00000355594 NISCHQ9Y2I1 1504 aa32.33■■■□□ 2.77
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ANKRD35-201ENST00000355594 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.89■■■□□ 2.06
ANKRD35-201ENST00000355594 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.42■■□□□ 1.98
ANKRD35-201ENST00000355594 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
ANKRD35-201ENST00000355594 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
ANKRD35-201ENST00000355594 ABCC9O60706 1549 aa26.81■■□□□ 1.88
ANKRD35-201ENST00000355594 SCRIBQ14160 1630 aa26.18■■□□□ 1.78
ANKRD35-201ENST00000355594 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.15■■□□□ 1.78
ANKRD35-201ENST00000355594 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.77■■□□□ 1.72
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ANKRD35-201ENST00000355594 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD35-201ENST00000355594 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.57■■□□□ 1.68
ANKRD35-201ENST00000355594 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.56■■□□□ 1.68
ANKRD35-201ENST00000355594 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.53■■□□□ 1.68
ANKRD35-201ENST00000355594 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
ANKRD35-201ENST00000355594 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.29■■□□□ 1.64
ANKRD35-201ENST00000355594 MROH2BQ7Z745 1585 aa25.27■■□□□ 1.64
ANKRD35-201ENST00000355594 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
ANKRD35-201ENST00000355594 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.15■■□□□ 1.62
ANKRD35-201ENST00000355594 WIZO95785 1651 aa25.08■■□□□ 1.6
ANKRD35-201ENST00000355594 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.05■■□□□ 1.6
ANKRD35-201ENST00000355594 TRIM41Q8WV44 630 aa25.03■■□□□ 1.6
ANKRD35-201ENST00000355594 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.87■■□□□ 1.57
ANKRD35-201ENST00000355594 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
ANKRD35-201ENST00000355594 SMARCA4P51532 1647 aa24.72■■□□□ 1.55
ANKRD35-201ENST00000355594 CCDC88BA6NC98 1476 aa24.58■■□□□ 1.53
ANKRD35-201ENST00000355594 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
ANKRD35-201ENST00000355594 ABCC8Q09428 1581 aa24.43■■□□□ 1.5
ANKRD35-201ENST00000355594 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.42■■□□□ 1.5
ANKRD35-201ENST00000355594 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.38■■□□□ 1.49
ANKRD35-201ENST00000355594 SMARCA2P51531 1590 aa24.37■■□□□ 1.49
ANKRD35-201ENST00000355594 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
ANKRD35-201ENST00000355594 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
ANKRD35-201ENST00000355594 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
ANKRD35-201ENST00000355594 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD35-201ENST00000355594 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
ANKRD35-201ENST00000355594 SOGA1O94964 1423 aa24.12■■□□□ 1.45
ANKRD35-201ENST00000355594 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
ANKRD35-201ENST00000355594 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.06■■□□□ 1.44
ANKRD35-201ENST00000355594 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.03■■□□□ 1.44
ANKRD35-201ENST00000355594 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.02■■□□□ 1.44
ANKRD35-201ENST00000355594 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
ANKRD35-201ENST00000355594 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD35-201ENST00000355594 NCAPD3P42695 1498 aa23.91■■□□□ 1.42
ANKRD35-201ENST00000355594 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.81■■□□□ 1.4
ANKRD35-201ENST00000355594 SYNJ1O43426 1573 aa23.81■■□□□ 1.4
ANKRD35-201ENST00000355594 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
ANKRD35-201ENST00000355594 HMGXB3Q12766 1538 aa23.69■■□□□ 1.38
ANKRD35-201ENST00000355594 NESP48681 1621 aa23.62■■□□□ 1.37
ANKRD35-201ENST00000355594 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.59■■□□□ 1.37
ANKRD35-201ENST00000355594 CEP162Q5TB80 1403 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD35-201ENST00000355594 HRCP23327 699 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD35-201ENST00000355594 CFTRP13569 1480 aa23.57■■□□□ 1.36
ANKRD35-201ENST00000355594 CUX1P39880 1505 aa23.51■■□□□ 1.35
ANKRD35-201ENST00000355594 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD35-201ENST00000355594 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.45■■□□□ 1.34
ANKRD35-201ENST00000355594 GOLGA3Q08378 1498 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35-201ENST00000355594 EEA1Q15075 1411 aa23.43■■□□□ 1.34
ANKRD35-201ENST00000355594 TOP2BQ02880 1626 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD35-201ENST00000355594 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.37■■□□□ 1.33
ANKRD35-201ENST00000355594 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.35■■□□□ 1.33
ANKRD35-201ENST00000355594 CUX2O14529 1486 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD35-201ENST00000355594 P3H3Q8IVL6 736 aa23.34■■□□□ 1.33
ANKRD35-201ENST00000355594 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
ANKRD35-201ENST00000355594 CLIP1P30622 1438 aa23.31■■□□□ 1.32
ANKRD35-201ENST00000355594 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.3■■□□□ 1.32
ANKRD35-201ENST00000355594 KIF27Q86VH2 1401 aa23.29■■□□□ 1.32
ANKRD35-201ENST00000355594 APLP2Q06481 763 aa23.28■■□□□ 1.32
ANKRD35-201ENST00000355594 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.27■■□□□ 1.32
ANKRD35-201ENST00000355594 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
ANKRD35-201ENST00000355594 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
ANKRD35-201ENST00000355594 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.21■■□□□ 1.31
ANKRD35-201ENST00000355594 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
ANKRD35-201ENST00000355594 IGF1RP08069 1367 aa23.17■■□□□ 1.3
ANKRD35-201ENST00000355594 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
ANKRD35-201ENST00000355594 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.11■■□□□ 1.29
ANKRD35-201ENST00000355594 KIF21BO75037 1637 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35-201ENST00000355594 PRXQ9BXM0 1461 aa23.09■■□□□ 1.29
ANKRD35-201ENST00000355594 TOPBP1Q92547 1522 aa23.08■■□□□ 1.28
ANKRD35-201ENST00000355594 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
ANKRD35-201ENST00000355594 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ANKRD35-201ENST00000355594 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35-201ENST00000355594 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35-201ENST00000355594 ITGAEP38570 1179 aa23.03■■□□□ 1.28
ANKRD35-201ENST00000355594 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.97■■□□□ 1.27
ANKRD35-201ENST00000355594 ARID3CA6NKF2 412 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD35-201ENST00000355594 ARAP1Q96P48 1450 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD35-201ENST00000355594 PRDM2Q13029 1718 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD35-201ENST00000355594 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD35-201ENST00000355594 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD35-201ENST00000355594 FBLN2P98095 1184 aa22.89■■□□□ 1.26
ANKRD35-201ENST00000355594 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.88■■□□□ 1.25
ANKRD35-201ENST00000355594 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.88■■□□□ 1.25
ANKRD35-201ENST00000355594 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.84■■□□□ 1.25
ANKRD35-201ENST00000355594 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.83■■□□□ 1.24
ANKRD35-201ENST00000355594 ERCC6Q03468 1493 aa22.82■■□□□ 1.24
ANKRD35-201ENST00000355594 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.79■■□□□ 1.24
ANKRD35-201ENST00000355594 FHOD3Q2V2M9 1422 aa22.77■■□□□ 1.24
ANKRD35-201ENST00000355594 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.77■■□□□ 1.24
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