RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524255.5

SFTPC-210, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SFTPC, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-210ENST00000524255 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.66■■■■■ 4.1
SFTPC-210ENST00000524255 ABCC9O60706 1549 aa37.23■■■■□ 3.55
SFTPC-210ENST00000524255 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.67■■■■□ 3.46
SFTPC-210ENST00000524255 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.33■■■■□ 3.25
SFTPC-210ENST00000524255 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.14■■■■□ 3.22
SFTPC-210ENST00000524255 NACADO15069 1562 aa34.76■■■■□ 3.16
SFTPC-210ENST00000524255 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.58■■■■□ 3.13
SFTPC-210ENST00000524255 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.57■■■■□ 3.12
SFTPC-210ENST00000524255 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.38■■■■□ 3.09
SFTPC-210ENST00000524255 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.19■■■■□ 3.06
SFTPC-210ENST00000524255 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.08■■■■□ 3.05
SFTPC-210ENST00000524255 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.61■■■□□ 2.97
SFTPC-210ENST00000524255 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.57■■■□□ 2.97
SFTPC-210ENST00000524255 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.56■■■□□ 2.96
SFTPC-210ENST00000524255 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.55■■■□□ 2.96
SFTPC-210ENST00000524255 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.49■■■□□ 2.95
SFTPC-210ENST00000524255 SCRIBQ14160 1630 aa33.49■■■□□ 2.95
SFTPC-210ENST00000524255 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
SFTPC-210ENST00000524255 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.71■■■□□ 2.83
SFTPC-210ENST00000524255 CUX2O14529 1486 aa32.19■■■□□ 2.74
SFTPC-210ENST00000524255 ERCC6Q03468 1493 aa32.15■■■□□ 2.74
SFTPC-210ENST00000524255 NCAPD3P42695 1498 aa32.1■■■□□ 2.73
SFTPC-210ENST00000524255 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.98■■■□□ 2.71
SFTPC-210ENST00000524255 NESP48681 1621 aa31.86■■■□□ 2.69
SFTPC-210ENST00000524255 SMARCA4P51532 1647 aa31.84■■■□□ 2.69
SFTPC-210ENST00000524255 HMGXB3Q12766 1538 aa31.84■■■□□ 2.69
SFTPC-210ENST00000524255 SMARCA2P51531 1590 aa31.83■■■□□ 2.69
SFTPC-210ENST00000524255 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
SFTPC-210ENST00000524255 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
SFTPC-210ENST00000524255 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
SFTPC-210ENST00000524255 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.47■■■□□ 2.63
SFTPC-210ENST00000524255 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.47■■■□□ 2.63
SFTPC-210ENST00000524255 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.4■■■□□ 2.62
SFTPC-210ENST00000524255 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.37■■■□□ 2.61
SFTPC-210ENST00000524255 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.29■■■□□ 2.6
SFTPC-210ENST00000524255 TRIM41Q8WV44 630 aa31.18■■■□□ 2.58
SFTPC-210ENST00000524255 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.12■■■□□ 2.57
SFTPC-210ENST00000524255 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.09■■■□□ 2.57
SFTPC-210ENST00000524255 WDR62O43379 1518 aa31.03■■■□□ 2.56
SFTPC-210ENST00000524255 WIZO95785 1651 aa30.98■■■□□ 2.55
SFTPC-210ENST00000524255 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.88■■■□□ 2.53
SFTPC-210ENST00000524255 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.81■■■□□ 2.52
SFTPC-210ENST00000524255 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
SFTPC-210ENST00000524255 CFTRP13569 1480 aa30.67■■■□□ 2.5
SFTPC-210ENST00000524255 OSCARQ8IYS5 282 aa30.62■■■□□ 2.49
SFTPC-210ENST00000524255 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
SFTPC-210ENST00000524255 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.52■■■□□ 2.48
SFTPC-210ENST00000524255 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
SFTPC-210ENST00000524255 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.36■■■□□ 2.45
SFTPC-210ENST00000524255 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.36■■■□□ 2.45
SFTPC-210ENST00000524255 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.36■■■□□ 2.45
SFTPC-210ENST00000524255 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.32■■■□□ 2.44
SFTPC-210ENST00000524255 PRDM2Q13029 1718 aa30.31■■■□□ 2.44
SFTPC-210ENST00000524255 IFT140Q96RY7 1462 aa30.25■■■□□ 2.43
SFTPC-210ENST00000524255 ARHGEF11O15085 1522 aa30.21■■■□□ 2.43
SFTPC-210ENST00000524255 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.19■■■□□ 2.42
SFTPC-210ENST00000524255 TOPBP1Q92547 1522 aa30.17■■■□□ 2.42
SFTPC-210ENST00000524255 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
SFTPC-210ENST00000524255 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.01■■■□□ 2.39
SFTPC-210ENST00000524255 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30■■■□□ 2.39
SFTPC-210ENST00000524255 ABCC8Q09428 1581 aa29.98■■■□□ 2.39
SFTPC-210ENST00000524255 CHD1O14646 1710 aa29.98■■■□□ 2.39
SFTPC-210ENST00000524255 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.97■■■□□ 2.39
SFTPC-210ENST00000524255 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
SFTPC-210ENST00000524255 ARAP1Q96P48 1450 aa29.89■■■□□ 2.38
SFTPC-210ENST00000524255 FBLN2P98095 1184 aa29.87■■■□□ 2.37
SFTPC-210ENST00000524255 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
SFTPC-210ENST00000524255 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
SFTPC-210ENST00000524255 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.77■■■□□ 2.36
SFTPC-210ENST00000524255 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
SFTPC-210ENST00000524255 SOGA1O94964 1423 aa29.67■■■□□ 2.34
SFTPC-210ENST00000524255 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.67■■■□□ 2.34
SFTPC-210ENST00000524255 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.61■■■□□ 2.33
SFTPC-210ENST00000524255 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.6■■■□□ 2.33
SFTPC-210ENST00000524255 SYNJ1O43426 1573 aa29.52■■■□□ 2.32
SFTPC-210ENST00000524255 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
SFTPC-210ENST00000524255 WDR97A6NE52 1622 aa29.52■■■□□ 2.32
SFTPC-210ENST00000524255 CUX1P39880 1505 aa29.5■■■□□ 2.31
SFTPC-210ENST00000524255 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
SFTPC-210ENST00000524255 GRIN2BQ13224 1484 aa29.46■■■□□ 2.31
SFTPC-210ENST00000524255 SYNJ2O15056 1496 aa29.42■■■□□ 2.3
SFTPC-210ENST00000524255 PBRM1Q86U86 1689 aa29.35■■■□□ 2.29
SFTPC-210ENST00000524255 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.32■■■□□ 2.28
SFTPC-210ENST00000524255 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
SFTPC-210ENST00000524255 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.23■■■□□ 2.27
SFTPC-210ENST00000524255 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.19■■■□□ 2.26
SFTPC-210ENST00000524255 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.18■■■□□ 2.26
SFTPC-210ENST00000524255 GRIN2AQ12879 1464 aa29.1■■■□□ 2.25
SFTPC-210ENST00000524255 ADAMTS12P58397 1594 aa29.05■■■□□ 2.24
SFTPC-210ENST00000524255 CEP170Q5SW79 1584 aa29.05■■■□□ 2.24
SFTPC-210ENST00000524255 NUP160Q12769 1436 aa29.01■■■□□ 2.23
SFTPC-210ENST00000524255 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.97■■■□□ 2.23
SFTPC-210ENST00000524255 SHROOM2Q13796 1616 aa28.94■■■□□ 2.22
SFTPC-210ENST00000524255 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.9■■■□□ 2.22
SFTPC-210ENST00000524255 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.87■■■□□ 2.21
SFTPC-210ENST00000524255 TOP2BQ02880 1626 aa28.86■■■□□ 2.21
SFTPC-210ENST00000524255 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.82■■■□□ 2.2
SFTPC-210ENST00000524255 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.79■■■□□ 2.2
SFTPC-210ENST00000524255 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.78■■■□□ 2.2
SFTPC-210ENST00000524255 JPH4Q96JJ6 628 aa28.68■■■□□ 2.18
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