Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E8

SLC9A8, Sodium/hydrogen exchanger 8, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A8Q9Y2E8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A8Q9Y2E8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A8Q9Y2E8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms