Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HHLA3Q9XRX5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HHLA3Q9XRX5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms