Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM47Q96LD4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM47Q96LD4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM47Q96LD4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms