Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLC3Q6P597 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLC3Q6P597 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms