Protein–RNA interactions for Protein: P49588

AARS, Alanine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AARSP49588 AC092175.1-201ENST00000605325 200 ntBASIC10.38□□□□□ -0.758e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.758e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACVR1-208ENST00000440523 534 ntTSL 310.21□□□□□ -0.778e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TGFB1-203ENST00000598758 559 ntTSL 510.17□□□□□ -0.788e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SMPD4P1-203ENST00000443839 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.88e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PTK2B-205ENST00000420218 3941 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.88e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PEX14-203ENST00000491661 637 ntTSL 210.03□□□□□ -0.88e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SETD5-210ENST00000442373 900 ntTSL 510.03□□□□□ -0.88e-6■■■■■ 52.4
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AARSP49588 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.828e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 UHRF1BP1-201ENST00000192788 9570 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.838e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SETD5-201ENST00000302463 4786 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.838e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PTK2B-201ENST00000346049 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.858e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACVR1-201ENST00000263640 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.868e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CHD8-210ENST00000555962 1232 ntTSL 59.68□□□□□ -0.868e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 FAM238C-205ENST00000640641 391 ntBASIC9.62□□□□□ -0.878e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.878e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SMARCC2-205ENST00000548130 1238 ntTSL 59.6□□□□□ -0.878e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CCDC144NL-AS1-217ENST00000583481 710 ntTSL 39.57□□□□□ -0.888e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-209ENST00000442555 3012 ntTSL 29.5□□□□□ -0.898e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SERPINB9-201ENST00000380698 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.898e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.938e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SMARCC2-206ENST00000549209 439 ntTSL 59.11□□□□□ -0.958e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.978e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.988e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 THOC5-216ENST00000490103 4753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -18e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MYCBP2-201ENST00000357337 14736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 TNPO2-217ENST00000590781 547 ntTSL 48.74□□□□□ -1.018e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC8.61□□□□□ -1.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 HIPK1-208ENST00000426820 4112 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.048e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SH3GL1-204ENST00000598219 619 ntTSL 38.5□□□□□ -1.058e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SETD5-221ENST00000478475 477 ntTSL 48.4□□□□□ -1.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AP002495.1-203ENST00000528560 659 ntTSL 58.23□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.098e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ZNFX1-202ENST00000371752 7212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.118e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 38.08□□□□□ -1.128e-6■■■■■ 52.4
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AARSP49588 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.238e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.238e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 VDAC1-205ENST00000466080 831 ntTSL 37.19□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 52.4
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AARSP49588 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.368e-6■■■■■ 52.4
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AARSP49588 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.418e-6■■■■■ 52.4
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AARSP49588 UTP4-212ENST00000567500 737 ntTSL 55.75□□□□□ -1.498e-6■■■■■ 52.4
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AARSP49588 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.568e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.578e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.658e-6■■■■■ 52.4
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AARSP49588 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.698e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RFC1-208ENST00000504849 873 ntTSL 34.43□□□□□ -1.78e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MEF2C-AS1-202ENST00000508521 427 ntTSL 54.17□□□□□ -1.748e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 DYRK4-206ENST00000538520 440 ntTSL 34.08□□□□□ -1.768e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 YWHAZ-218ENST00000521607 750 ntTSL 33.78□□□□□ -1.88e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 MAP3K20-207ENST00000480606 821 ntTSL 53.48□□□□□ -1.858e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.938e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 EHMT1-229ENST00000636081 100 ntTSL 52.37□□□□□ -2.038e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.068e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 SETD5-216ENST00000466172 248 ntTSL 21.85□□□□□ -2.118e-6■■■■■ 52.4
AARSP49588 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-6■■■■■ 52
AARSP49588 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.033e-6■■■■■ 52
AARSP49588 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 52
AARSP49588 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 215.99■□□□□ 0.155e-6■■■■■ 52
AARSP49588 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 315.64■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 51.9
AARSP49588 MAP3K20-205ENST00000468408 585 ntTSL 318.92■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 51.7
AARSP49588 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 51.7
AARSP49588 MAP3K20-206ENST00000476618 4010 ntTSL 1 (best)10.55□□□□□ -0.724e-6■■■■■ 51.7
AARSP49588 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.894e-6■■■■■ 51.7
AARSP49588 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.044e-6■■■■■ 51.7
AARSP49588 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.574e-6■■■■■ 51.7
AARSP49588 RETSAT-205ENST00000449375 1759 ntTSL 515.93■□□□□ 0.142e-9■■■■■ 51.5
AARSP49588 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.82■□□□□ 0.122e-9■■■■■ 51.5
AARSP49588 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.092e-9■■■■■ 51.5
AARSP49588 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-6■■■■■ 51.5
AARSP49588 RETSAT-203ENST00000429806 2335 ntTSL 1 (best)14.26□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 51.5
AARSP49588 RERE-201ENST00000337907 8026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 51.5
AARSP49588 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 51.5
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