Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL1P40616 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL1P40616 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL1P40616 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL1P40616 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL1P40616 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARL1P40616 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARL1P40616 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARL1P40616 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARL1P40616 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL1P40616 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL1P40616 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL1P40616 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARL1P40616 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARL1P40616 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARL1P40616 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ARL1P40616 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL1P40616 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL1P40616 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL1P40616 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL1P40616 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL1P40616 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARL1P40616 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL1P40616 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL1P40616 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL1P40616 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL1P40616 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL1P40616 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL1P40616 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARL1P40616 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL1P40616 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL1P40616 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL1P40616 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL1P40616 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL1P40616 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARL1P40616 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARL1P40616 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms