Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCATO75600 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GCATO75600 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GCATO75600 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GCATO75600 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCATO75600 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCATO75600 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCATO75600 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCATO75600 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GCATO75600 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GCATO75600 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GCATO75600 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCATO75600 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCATO75600 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCATO75600 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCATO75600 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCATO75600 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCATO75600 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCATO75600 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GCATO75600 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCATO75600 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCATO75600 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GCATO75600 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCATO75600 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCATO75600 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCATO75600 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCATO75600 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GCATO75600 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GCATO75600 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCATO75600 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GCATO75600 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GCATO75600 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GCATO75600 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCATO75600 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCATO75600 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCATO75600 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GCATO75600 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCATO75600 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCATO75600 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCATO75600 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GCATO75600 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCATO75600 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCATO75600 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCATO75600 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GCATO75600 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GCATO75600 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCATO75600 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCATO75600 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GCATO75600 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms