Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RPA4Q13156 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPA4Q13156 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPA4Q13156 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPA4Q13156 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RPA4Q13156 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RPA4Q13156 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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RPA4Q13156 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RPA4Q13156 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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