Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RPA4Q13156 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RPA4Q13156 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
RPA4Q13156 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RPA4Q13156 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RPA4Q13156 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RPA4Q13156 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
RPA4Q13156 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RPA4Q13156 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
RPA4Q13156 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RPA4Q13156 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RPA4Q13156 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
RPA4Q13156 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RPA4Q13156 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RPA4Q13156 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
RPA4Q13156 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RPA4Q13156 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RPA4Q13156 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RPA4Q13156 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
RPA4Q13156 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
RPA4Q13156 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RPA4Q13156 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RPA4Q13156 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RPA4Q13156 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RPA4Q13156 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RPA4Q13156 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RPA4Q13156 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RPA4Q13156 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RPA4Q13156 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RPA4Q13156 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RPA4Q13156 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RPA4Q13156 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RPA4Q13156 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPA4Q13156 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RPA4Q13156 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RPA4Q13156 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RPA4Q13156 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPA4Q13156 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RPA4Q13156 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPA4Q13156 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RPA4Q13156 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RPA4Q13156 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RPA4Q13156 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPA4Q13156 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RPA4Q13156 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RPA4Q13156 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
RPA4Q13156 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RPA4Q13156 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RPA4Q13156 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RPA4Q13156 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
RPA4Q13156 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RPA4Q13156 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RPA4Q13156 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RPA4Q13156 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RPA4Q13156 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RPA4Q13156 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RPA4Q13156 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RPA4Q13156 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPA4Q13156 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPA4Q13156 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RPA4Q13156 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RPA4Q13156 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RPA4Q13156 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RPA4Q13156 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RPA4Q13156 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RPA4Q13156 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RPA4Q13156 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RPA4Q13156 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RPA4Q13156 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RPA4Q13156 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RPA4Q13156 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RPA4Q13156 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RPA4Q13156 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RPA4Q13156 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPA4Q13156 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RPA4Q13156 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RPA4Q13156 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RPA4Q13156 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RPA4Q13156 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA4Q13156 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RPA4Q13156 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPA4Q13156 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RPA4Q13156 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RPA4Q13156 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPA4Q13156 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RPA4Q13156 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPA4Q13156 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RPA4Q13156 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RPA4Q13156 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPA4Q13156 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RPA4Q13156 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RPA4Q13156 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RPA4Q13156 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RPA4Q13156 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPA4Q13156 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RPA4Q13156 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RPA4Q13156 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RPA4Q13156 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RPA4Q13156 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RPA4Q13156 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms