Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
SLC25A20O43772 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CMC2-201ENST00000219400 10301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
SLC25A20O43772 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms