RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360325.11

CLDN7-201, Transcript of claudin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLDN7, Length 1,542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7-201ENST00000360325 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.67■■■■□ 3.94
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CLDN7-201ENST00000360325 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.78■■■□□ 2.84
CLDN7-201ENST00000360325 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.59■■■□□ 2.81
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CLDN7-201ENST00000360325 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.28■■■□□ 2.76
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CLDN7-201ENST00000360325 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.24■■■□□ 2.43
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CLDN7-201ENST00000360325 SMARCA2P51531 1590 aa30.15■■■□□ 2.42
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CLDN7-201ENST00000360325 PRDM2Q13029 1718 aa29.04■■■□□ 2.24
CLDN7-201ENST00000360325 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.02■■■□□ 2.24
CLDN7-201ENST00000360325 NESP48681 1621 aa29■■■□□ 2.23
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CLDN7-201ENST00000360325 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.84■■■□□ 2.21
CLDN7-201ENST00000360325 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.83■■■□□ 2.21
CLDN7-201ENST00000360325 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.79■■■□□ 2.2
CLDN7-201ENST00000360325 SYNJ1O43426 1573 aa28.72■■■□□ 2.19
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CLDN7-201ENST00000360325 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.66■■■□□ 2.18
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CLDN7-201ENST00000360325 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.64■■■□□ 2.18
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CLDN7-201ENST00000360325 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.39■■■□□ 2.14
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CLDN7-201ENST00000360325 KIF27Q86VH2 1401 aa28.13■■■□□ 2.09
CLDN7-201ENST00000360325 WDR97A6NE52 1622 aa28.11■■■□□ 2.09
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CLDN7-201ENST00000360325 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.6■■■□□ 2.01
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CLDN7-201ENST00000360325 CEP162Q5TB80 1403 aa27.47■■□□□ 1.99
CLDN7-201ENST00000360325 SYNJ2O15056 1496 aa27.46■■□□□ 1.99
CLDN7-201ENST00000360325 GRIN2AQ12879 1464 aa27.41■■□□□ 1.98
CLDN7-201ENST00000360325 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa27.39■■□□□ 1.98
CLDN7-201ENST00000360325 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
CLDN7-201ENST00000360325 CLIP1P30622 1438 aa27.35■■□□□ 1.97
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