Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HOXB9P17482 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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