Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CENPJQ9HC77 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CENPJQ9HC77 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms