RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360221.8

PTGES3L-AARSD1-201, Transcript of PTGES3L-AARSD1 readthrough, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTGES3L-AARSD1, Length 1,790 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.37■■■■□ 3.25
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.69■■■□□ 2.5
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.35
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.34■■■□□ 2.29
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.98■■■□□ 2.23
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.93■■■□□ 2.22
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.84■■■□□ 2.21
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ABCC9O60706 1549 aa28.73■■■□□ 2.19
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 NACADO15069 1562 aa28.58■■■□□ 2.17
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.23■■■□□ 2.11
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 SCRIBQ14160 1630 aa28.15■■■□□ 2.1
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.55■■■□□ 2
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.42■■□□□ 1.98
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.38■■□□□ 1.97
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.29■■□□□ 1.96
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 SMARCA4P51532 1647 aa27.09■■□□□ 1.93
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 WIZO95785 1651 aa27.02■■□□□ 1.92
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.97■■□□□ 1.91
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.84■■□□□ 1.89
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.64■■□□□ 1.85
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 SMARCA2P51531 1590 aa26.61■■□□□ 1.85
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.56■■□□□ 1.84
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 NCAPD3P42695 1498 aa26.43■■□□□ 1.82
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 HMGXB3Q12766 1538 aa26.35■■□□□ 1.81
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 TRIM41Q8WV44 630 aa26.3■■□□□ 1.8
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.03■■□□□ 1.76
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ABCC8Q09428 1581 aa25.98■■□□□ 1.75
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.89■■□□□ 1.73
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CFTRP13569 1480 aa25.87■■□□□ 1.73
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.87■■□□□ 1.73
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.73■■□□□ 1.71
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 EEA1Q15075 1411 aa25.72■■□□□ 1.71
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 SYNJ1O43426 1573 aa25.71■■□□□ 1.71
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 TOP2BQ02880 1626 aa25.64■■□□□ 1.69
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 PRDM2Q13029 1718 aa25.61■■□□□ 1.69
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 SOGA1O94964 1423 aa25.61■■□□□ 1.69
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.6■■□□□ 1.69
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.52■■□□□ 1.68
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CUX1P39880 1505 aa25.5■■□□□ 1.67
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.48■■□□□ 1.67
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.41■■□□□ 1.66
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.39■■□□□ 1.65
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.32■■□□□ 1.64
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 NESP48681 1621 aa25.31■■□□□ 1.64
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.3■■□□□ 1.64
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 GOLGA3Q08378 1498 aa25.3■■□□□ 1.64
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.3■■□□□ 1.64
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 KIF21BO75037 1637 aa25.29■■□□□ 1.64
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.24■■□□□ 1.63
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.23■■□□□ 1.63
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 KIF27Q86VH2 1401 aa25.23■■□□□ 1.63
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.21■■□□□ 1.63
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.17■■□□□ 1.62
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 PRXQ9BXM0 1461 aa25.15■■□□□ 1.62
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 TOPBP1Q92547 1522 aa25.15■■□□□ 1.62
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CEP162Q5TB80 1403 aa25.12■■□□□ 1.61
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.11■■□□□ 1.61
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.08■■□□□ 1.61
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CUX2O14529 1486 aa25.05■■□□□ 1.6
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.03■■□□□ 1.6
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 IGF1RP08069 1367 aa25.02■■□□□ 1.6
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.59
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.95■■□□□ 1.58
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.92■■□□□ 1.58
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.9■■□□□ 1.58
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CLIP1P30622 1438 aa24.89■■□□□ 1.57
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.87■■□□□ 1.57
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.86■■□□□ 1.57
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 WDR97A6NE52 1622 aa24.83■■□□□ 1.57
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.74■■□□□ 1.55
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.73■■□□□ 1.55
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 WDR62O43379 1518 aa24.73■■□□□ 1.55
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 CUL7Q14999 1698 aa24.73■■□□□ 1.55
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.69■■□□□ 1.54
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 IFT140Q96RY7 1462 aa24.63■■□□□ 1.53
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ARAP1Q96P48 1450 aa24.61■■□□□ 1.53
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ERCC6Q03468 1493 aa24.61■■□□□ 1.53
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.58■■□□□ 1.52
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 GRIN2BQ13224 1484 aa24.49■■□□□ 1.51
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.48■■□□□ 1.511e-6■■■■□ 24.1
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.47■■□□□ 1.51
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 HRCP23327 699 aa24.47■■□□□ 1.51
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 APLP2Q06481 763 aa24.44■■□□□ 1.5
PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 PBRM1Q86U86 1689 aa24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms