RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473970.2

RPARP-AS1-201, RPARP antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPARP-AS1, Length 1,297 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.26■■■■□ 3.55
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.59■■■□□ 2.65
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NACADO15069 1562 aa31.47■■■□□ 2.63
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.23■■■□□ 2.59
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.09■■■□□ 2.57
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.88■■■□□ 2.53
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 SCRIBQ14160 1630 aa30.27■■■□□ 2.44
RPARP-AS1-201ENST00000473970 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.23■■■□□ 2.43
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.81■■■□□ 2.36
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.65■■■□□ 2.34
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NCAPD3P42695 1498 aa29.03■■■□□ 2.24
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SMARCA4P51532 1647 aa29■■■□□ 2.23
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 SMARCA2P51531 1590 aa28.92■■■□□ 2.22
RPARP-AS1-201ENST00000473970 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.92■■■□□ 2.22
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.8■■■□□ 2.2
RPARP-AS1-201ENST00000473970 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.65■■■□□ 2.18
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ERCC6Q03468 1493 aa28.4■■■□□ 2.14
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CUX2O14529 1486 aa28.36■■■□□ 2.13
RPARP-AS1-201ENST00000473970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.34■■■□□ 2.13
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NESP48681 1621 aa28.33■■■□□ 2.13
RPARP-AS1-201ENST00000473970 WIZO95785 1651 aa28.32■■■□□ 2.12
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.26■■■□□ 2.11
RPARP-AS1-201ENST00000473970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.13■■■□□ 2.09
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.12■■■□□ 2.09
RPARP-AS1-201ENST00000473970 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.07■■■□□ 2.08
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.94■■■□□ 2.06
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CFTRP13569 1480 aa27.89■■■□□ 2.05
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.84■■■□□ 2.05
RPARP-AS1-201ENST00000473970 WDR62O43379 1518 aa27.8■■■□□ 2.04
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.78■■■□□ 2.04
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.77■■■□□ 2.04
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PRDM2Q13029 1718 aa27.72■■■□□ 2.03
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.67■■■□□ 2.02
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 TOPBP1Q92547 1522 aa27.3■■□□□ 1.96
RPARP-AS1-201ENST00000473970 IFT140Q96RY7 1462 aa27.25■■□□□ 1.95
RPARP-AS1-201ENST00000473970 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.25■■□□□ 1.95
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 SOGA1O94964 1423 aa26.9■■□□□ 1.9
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 CHD1O14646 1710 aa26.77■■□□□ 1.88
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.67■■□□□ 1.86
RPARP-AS1-201ENST00000473970 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.67■■□□□ 1.86
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GRIN2BQ13224 1484 aa26.67■■□□□ 1.86
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.64■■□□□ 1.85
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.63■■□□□ 1.85
RPARP-AS1-201ENST00000473970 TOP2BQ02880 1626 aa26.62■■□□□ 1.85
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ARHGEF11O15085 1522 aa26.61■■□□□ 1.85
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.59■■□□□ 1.85
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.59■■□□□ 1.85
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PBRM1Q86U86 1689 aa26.59■■□□□ 1.85
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FBLN2P98095 1184 aa26.57■■□□□ 1.84
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SYNJ2O15056 1496 aa26.55■■□□□ 1.84
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SYNJ1O43426 1573 aa26.53■■□□□ 1.84
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 ARAP1Q96P48 1450 aa26.36■■□□□ 1.81
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.35■■□□□ 1.81
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ADAMTS12P58397 1594 aa26.34■■□□□ 1.81
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GRIN2AQ12879 1464 aa26.31■■□□□ 1.8
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.31■■□□□ 1.8
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.29■■□□□ 1.8
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NUP160Q12769 1436 aa26.23■■□□□ 1.79
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CEP170Q5SW79 1584 aa26.18■■□□□ 1.78
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SHROOM2Q13796 1616 aa26.13■■□□□ 1.77
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KIF27Q86VH2 1401 aa26.08■■□□□ 1.77
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CUL7Q14999 1698 aa26.04■■□□□ 1.76
RPARP-AS1-201ENST00000473970 IGF1RP08069 1367 aa26.02■■□□□ 1.76
RPARP-AS1-201ENST00000473970 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.99■■□□□ 1.75
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