RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473970.2

RPARP-AS1-201, RPARP antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPARP-AS1, Length 1,297 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.26■■■■□ 3.55
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.59■■■□□ 2.65
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NACADO15069 1562 aa31.47■■■□□ 2.63
RPARP-AS1-201ENST00000473970 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.23■■■□□ 2.59
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 SMARCA2P51531 1590 aa28.92■■■□□ 2.22
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.8■■■□□ 2.2
RPARP-AS1-201ENST00000473970 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.34■■■□□ 2.13
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NESP48681 1621 aa28.33■■■□□ 2.13
RPARP-AS1-201ENST00000473970 WIZO95785 1651 aa28.32■■■□□ 2.12
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.26■■■□□ 2.11
RPARP-AS1-201ENST00000473970 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.12■■■□□ 2.09
RPARP-AS1-201ENST00000473970 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.07■■■□□ 2.08
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 WDR62O43379 1518 aa27.8■■■□□ 2.04
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.78■■■□□ 2.04
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.77■■■□□ 2.04
RPARP-AS1-201ENST00000473970 PRDM2Q13029 1718 aa27.72■■■□□ 2.03
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.67■■■□□ 2.02
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 SOGA1O94964 1423 aa26.9■■□□□ 1.9
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.67■■□□□ 1.86
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.59■■□□□ 1.85
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 SYNJ1O43426 1573 aa26.53■■□□□ 1.84
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 ADAMTS12P58397 1594 aa26.34■■□□□ 1.81
RPARP-AS1-201ENST00000473970 GRIN2AQ12879 1464 aa26.31■■□□□ 1.8
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.31■■□□□ 1.8
RPARP-AS1-201ENST00000473970 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.29■■□□□ 1.8
RPARP-AS1-201ENST00000473970 NUP160Q12769 1436 aa26.23■■□□□ 1.79
RPARP-AS1-201ENST00000473970 CEP170Q5SW79 1584 aa26.18■■□□□ 1.78
RPARP-AS1-201ENST00000473970 SHROOM2Q13796 1616 aa26.13■■□□□ 1.77
RPARP-AS1-201ENST00000473970 KIF27Q86VH2 1401 aa26.08■■□□□ 1.77
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RPARP-AS1-201ENST00000473970 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.99■■□□□ 1.75
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