Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHRAC1Q9NRG0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHRAC1Q9NRG0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CHRAC1Q9NRG0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms