Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX73

TM2D2, TM2 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2Q9BX73 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TM2D2Q9BX73 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TM2D2Q9BX73 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TM2D2Q9BX73 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms