Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX73

TM2D2, TM2 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2Q9BX73 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM2D2Q9BX73 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM2D2Q9BX73 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TM2D2Q9BX73 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TM2D2Q9BX73 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM2D2Q9BX73 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM2D2Q9BX73 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TM2D2Q9BX73 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM2D2Q9BX73 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TM2D2Q9BX73 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TM2D2Q9BX73 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM2D2Q9BX73 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TM2D2Q9BX73 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TM2D2Q9BX73 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM2D2Q9BX73 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM2D2Q9BX73 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM2D2Q9BX73 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM2D2Q9BX73 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TM2D2Q9BX73 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TM2D2Q9BX73 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TM2D2Q9BX73 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TM2D2Q9BX73 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TM2D2Q9BX73 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TM2D2Q9BX73 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TM2D2Q9BX73 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TM2D2Q9BX73 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TM2D2Q9BX73 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TM2D2Q9BX73 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TM2D2Q9BX73 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TM2D2Q9BX73 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM2D2Q9BX73 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TM2D2Q9BX73 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TM2D2Q9BX73 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D2Q9BX73 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TM2D2Q9BX73 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM2D2Q9BX73 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TM2D2Q9BX73 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TM2D2Q9BX73 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TM2D2Q9BX73 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TM2D2Q9BX73 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TM2D2Q9BX73 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TM2D2Q9BX73 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TM2D2Q9BX73 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TM2D2Q9BX73 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TM2D2Q9BX73 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM2D2Q9BX73 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TM2D2Q9BX73 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TM2D2Q9BX73 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D2Q9BX73 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TM2D2Q9BX73 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TM2D2Q9BX73 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TM2D2Q9BX73 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TM2D2Q9BX73 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TM2D2Q9BX73 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TM2D2Q9BX73 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TM2D2Q9BX73 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TM2D2Q9BX73 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TM2D2Q9BX73 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TM2D2Q9BX73 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TM2D2Q9BX73 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TM2D2Q9BX73 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TM2D2Q9BX73 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TM2D2Q9BX73 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TM2D2Q9BX73 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TM2D2Q9BX73 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TM2D2Q9BX73 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TM2D2Q9BX73 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TM2D2Q9BX73 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM2D2Q9BX73 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TM2D2Q9BX73 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TM2D2Q9BX73 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM2D2Q9BX73 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TM2D2Q9BX73 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TM2D2Q9BX73 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TM2D2Q9BX73 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D2Q9BX73 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D2Q9BX73 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TM2D2Q9BX73 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TM2D2Q9BX73 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TM2D2Q9BX73 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D2Q9BX73 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TM2D2Q9BX73 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM2D2Q9BX73 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TM2D2Q9BX73 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM2D2Q9BX73 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM2D2Q9BX73 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM2D2Q9BX73 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TM2D2Q9BX73 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D2Q9BX73 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TM2D2Q9BX73 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TM2D2Q9BX73 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms