Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NIPSNAP1Q9BPW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NIPSNAP1Q9BPW8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms