Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MFSD3Q96ES6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MFSD3Q96ES6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MFSD3Q96ES6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms