Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTC1Q2NKJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTC1Q2NKJ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CTC1Q2NKJ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTC1Q2NKJ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms