Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TACR1P25103 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TACR1P25103 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR1P25103 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR1P25103 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR1P25103 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR1P25103 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TACR1P25103 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TACR1P25103 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR1P25103 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR1P25103 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR1P25103 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR1P25103 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR1P25103 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TACR1P25103 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TACR1P25103 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TACR1P25103 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR1P25103 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR1P25103 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR1P25103 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR1P25103 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR1P25103 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR1P25103 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR1P25103 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TACR1P25103 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TACR1P25103 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TACR1P25103 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TACR1P25103 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TACR1P25103 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TACR1P25103 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms