Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CTLA4P16410 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CTLA4P16410 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTLA4P16410 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms