Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC1P02654 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC1P02654 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC1P02654 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
APOC1P02654 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
APOC1P02654 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
APOC1P02654 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC1P02654 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC1P02654 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC1P02654 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC1P02654 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC1P02654 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
APOC1P02654 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC1P02654 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC1P02654 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC1P02654 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC1P02654 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC1P02654 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
APOC1P02654 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APOC1P02654 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APOC1P02654 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APOC1P02654 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC1P02654 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC1P02654 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC1P02654 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC1P02654 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC1P02654 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
APOC1P02654 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC1P02654 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC1P02654 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC1P02654 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC1P02654 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC1P02654 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
APOC1P02654 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC1P02654 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC1P02654 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC1P02654 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APOC1P02654 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APOC1P02654 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms