Protein–RNA interactions for Protein: P01730

CD4, T-cell surface glycoprotein CD4, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD4P01730 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD4P01730 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CD4P01730 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD4P01730 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD4P01730 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CD4P01730 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CD4P01730 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CD4P01730 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CD4P01730 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD4P01730 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD4P01730 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD4P01730 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CD4P01730 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CD4P01730 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CD4P01730 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CD4P01730 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD4P01730 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD4P01730 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD4P01730 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CD4P01730 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD4P01730 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD4P01730 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD4P01730 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD4P01730 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CD4P01730 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD4P01730 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CD4P01730 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CD4P01730 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD4P01730 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD4P01730 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD4P01730 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD4P01730 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD4P01730 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD4P01730 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CD4P01730 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD4P01730 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD4P01730 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD4P01730 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD4P01730 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD4P01730 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD4P01730 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD4P01730 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CD4P01730 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CD4P01730 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD4P01730 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD4P01730 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD4P01730 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD4P01730 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD4P01730 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CD4P01730 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD4P01730 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD4P01730 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD4P01730 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD4P01730 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CD4P01730 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD4P01730 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD4P01730 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD4P01730 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD4P01730 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD4P01730 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD4P01730 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CD4P01730 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD4P01730 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD4P01730 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CD4P01730 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CD4P01730 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD4P01730 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD4P01730 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CD4P01730 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CD4P01730 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD4P01730 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD4P01730 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CD4P01730 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CD4P01730 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD4P01730 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD4P01730 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD4P01730 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CD4P01730 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CD4P01730 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms