Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GADD45BO75293 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GADD45BO75293 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GADD45BO75293 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms