Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ALCAMQ13740 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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