Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
LIN28AQ9H9Z2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIN28AQ9H9Z2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LIN28AQ9H9Z2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms