Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MS4A8Q9BY19 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A8Q9BY19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A8Q9BY19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms