Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CLIC6Q96NY7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIC6Q96NY7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLIC6Q96NY7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms