Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ASIC4Q96FT7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ASIC4Q96FT7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ASIC4Q96FT7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ASIC4Q96FT7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 918.8 ms