Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RHBDD1Q8TEB9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RHBDD1Q8TEB9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHBDD1Q8TEB9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms