Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCT6

SPPL3, Signal peptide peptidase-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL3Q8TCT6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPPL3Q8TCT6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPPL3Q8TCT6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPPL3Q8TCT6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms