Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SVIPQ8NHG7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SVIPQ8NHG7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SVIPQ8NHG7 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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