Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RABGGTBP53611 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RABGGTBP53611 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RABGGTBP53611 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RABGGTBP53611 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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