Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SYNMO15061 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SYNMO15061 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNMO15061 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
SYNMO15061 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
SYNMO15061 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNMO15061 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNMO15061 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNMO15061 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
SYNMO15061 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNMO15061 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNMO15061 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNMO15061 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNMO15061 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SYNMO15061 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNMO15061 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNMO15061 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNMO15061 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
SYNMO15061 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNMO15061 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNMO15061 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNMO15061 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNMO15061 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
SYNMO15061 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNMO15061 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNMO15061 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNMO15061 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNMO15061 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNMO15061 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNMO15061 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNMO15061 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SYNMO15061 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNMO15061 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
SYNMO15061 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNMO15061 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNMO15061 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNMO15061 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SYNMO15061 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNMO15061 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNMO15061 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNMO15061 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNMO15061 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNMO15061 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SYNMO15061 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNMO15061 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNMO15061 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNMO15061 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNMO15061 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNMO15061 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNMO15061 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SYNMO15061 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNMO15061 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNMO15061 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNMO15061 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
SYNMO15061 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNMO15061 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNMO15061 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNMO15061 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SYNMO15061 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
SYNMO15061 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SYNMO15061 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNMO15061 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNMO15061 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SYNMO15061 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNMO15061 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNMO15061 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SYNMO15061 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNMO15061 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNMO15061 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNMO15061 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SYNMO15061 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNMO15061 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNMO15061 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNMO15061 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNMO15061 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SYNMO15061 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNMO15061 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNMO15061 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SYNMO15061 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNMO15061 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNMO15061 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNMO15061 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SYNMO15061 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNMO15061 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNMO15061 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNMO15061 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SYNMO15061 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYNMO15061 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYNMO15061 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SYNMO15061 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNMO15061 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNMO15061 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNMO15061 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNMO15061 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNMO15061 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNMO15061 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SYNMO15061 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNMO15061 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SYNMO15061 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SYNMO15061 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms