Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUL3

STAU2, Double-stranded RNA-binding protein Staufen homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAU2Q9NUL3 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.16e-7■■■■□ 23.9
STAU2Q9NUL3 MSI2-215ENST00000582453 496 ntTSL 32.9□□□□□ -1.956e-7■■■■□ 23.9
STAU2Q9NUL3 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.266e-7■■■■□ 23.8
STAU2Q9NUL3 AC073610.2-201ENST00000537495 406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.286e-7■■■■□ 23.8
STAU2Q9NUL3 AC073610.3-201ENST00000398092 939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.876e-7■■■■□ 23.8
STAU2Q9NUL3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.799e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.799e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 415.14■□□□□ 0.019e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-214ENST00000535493 2743 ntTSL 213.94□□□□□ -0.189e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-208ENST00000463007 3158 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.349e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-216ENST00000544989 342 ntTSL 511.99□□□□□ -0.499e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.499e-8■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.955e-7■■■■□ 23.7
STAU2Q9NUL3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.875e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.355e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.145e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.125e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 AGAP1-212ENST00000614409 9932 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.65e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 AGAP1-207ENST00000428334 10090 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.735e-7■■■■□ 23.6
STAU2Q9NUL3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-205ENST00000485923 1078 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-207ENST00000615547 3488 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.762e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-202ENST00000471696 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.052e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-206ENST00000492132 819 ntTSL 57.75□□□□□ -1.172e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.472e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 SELENOT-201ENST00000466234 585 ntTSL 22.58□□□□□ -22e-7■■■■□ 23.3
STAU2Q9NUL3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.11e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 519.4■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 319.4■□□□□ 0.71e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 517.57■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.351e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-212ENST00000478754 2932 ntTSL 517.17■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 416.88■□□□□ 0.291e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 510.94□□□□□ -0.661e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.31□□□□□ -0.921e-6■■■■□ 23.1
STAU2Q9NUL3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.19e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.619e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CHTF8-201ENST00000306585 2561 ntBASIC11.99□□□□□ -0.499e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CHTF8-206ENST00000519534 723 ntTSL 211.14□□□□□ -0.639e-7■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.054e-13■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CPT1A-206ENST00000540367 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.554e-13■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.674e-13■■■■□ 22.9
STAU2Q9NUL3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.572e-7■■■■□ 22.8
STAU2Q9NUL3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 22.8
STAU2Q9NUL3 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.85□□□□□ -1.632e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.42e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 216.66■□□□□ 0.262e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 GET4-205ENST00000441491 682 ntTSL 515.4■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 215.15■□□□□ 0.022e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.042e-7■■■■□ 22.3
STAU2Q9NUL3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.049e-7■■■■□ 22.2
STAU2Q9NUL3 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 516.37■□□□□ 0.219e-7■■■■□ 22.2
STAU2Q9NUL3 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 22.2
STAU2Q9NUL3 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 22.2
STAU2Q9NUL3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.192e-6■■■■□ 22.1
STAU2Q9NUL3 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■□ 22.1
STAU2Q9NUL3 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.1
STAU2Q9NUL3 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.392e-6■■■■□ 22.1
STAU2Q9NUL3 INS-IGF2-205ENST00000641326 2861 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.411e-323■■■■□ 21.8
STAU2Q9NUL3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-14■■■■□ 21.7
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.725e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.695e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-207ENST00000564098 4436 ntTSL 216.34■□□□□ 0.215e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 MAPK8IP3-203ENST00000561765 2374 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 21.6
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.887e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.477e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-221ENST00000577079 814 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.14■□□□□ 0.337e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 416.47■□□□□ 0.237e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.147e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-217ENST00000575634 571 ntTSL 415.01□□□□□ -0.017e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 413.77□□□□□ -0.217e-7■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-203ENST00000453989 792 ntTSL 324.29■■□□□ 1.481e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-208ENST00000544902 1571 ntTSL 222.82■■□□□ 1.241e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-202ENST00000408980 866 ntTSL 522.79■■□□□ 1.241e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-206ENST00000475254 804 ntTSL 319.06■□□□□ 0.641e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 313.51□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 MSI2-214ENST00000581776 493 ntTSL 25.24□□□□□ -1.571e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 MSI2-212ENST00000579590 452 ntTSL 54.68□□□□□ -1.661e-6■■■■□ 21.5
STAU2Q9NUL3 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-6■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.987e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.767e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-214ENST00000423251 734 ntTSL 319.21■□□□□ 0.677e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 PIGT-248ENST00000639783 1691 ntTSL 218.32■□□□□ 0.527e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.477e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 RPH3AL-218ENST00000575736 566 ntTSL 517.06■□□□□ 0.327e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 514.55□□□□□ -0.087e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.167e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.437e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-231ENST00000494043 896 ntTSL 311.85□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 UPF1-213ENST00000601981 556 ntTSL 510.33□□□□□ -0.767e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 MCF2L-223ENST00000473345 399 ntTSL 39.48□□□□□ -0.897e-7■■■■□ 21.4
STAU2Q9NUL3 OAZ1-206ENST00000589739 657 ntTSL 218.34■□□□□ 0.532e-18■■■■□ 21.2
STAU2Q9NUL3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 21.1
STAU2Q9NUL3 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.143e-6■■■■□ 21.1
STAU2Q9NUL3 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.093e-6■■■■□ 21.1
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