Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CACNG6Q9BXT2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG6Q9BXT2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CACNG6Q9BXT2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CACNG6Q9BXT2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG6Q9BXT2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CACNG6Q9BXT2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CACNG6Q9BXT2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CACNG6Q9BXT2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CACNG6Q9BXT2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG6Q9BXT2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG6Q9BXT2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CACNG6Q9BXT2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CACNG6Q9BXT2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CACNG6Q9BXT2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CACNG6Q9BXT2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CACNG6Q9BXT2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CACNG6Q9BXT2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CACNG6Q9BXT2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNG6Q9BXT2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNG6Q9BXT2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG6Q9BXT2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNG6Q9BXT2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNG6Q9BXT2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNG6Q9BXT2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNG6Q9BXT2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNG6Q9BXT2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNG6Q9BXT2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNG6Q9BXT2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNG6Q9BXT2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG6Q9BXT2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG6Q9BXT2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CACNG6Q9BXT2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CACNG6Q9BXT2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CACNG6Q9BXT2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CACNG6Q9BXT2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CACNG6Q9BXT2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CACNG6Q9BXT2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNG6Q9BXT2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNG6Q9BXT2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG6Q9BXT2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNG6Q9BXT2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG6Q9BXT2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNG6Q9BXT2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNG6Q9BXT2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG6Q9BXT2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNG6Q9BXT2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms