Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PCNX1Q96RV3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX1Q96RV3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX1Q96RV3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCNX1Q96RV3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCNX1Q96RV3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCNX1Q96RV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCNX1Q96RV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX1Q96RV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCNX1Q96RV3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCNX1Q96RV3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PCNX1Q96RV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNX1Q96RV3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCNX1Q96RV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNX1Q96RV3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCNX1Q96RV3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCNX1Q96RV3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX1Q96RV3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCNX1Q96RV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCNX1Q96RV3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCNX1Q96RV3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX1Q96RV3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCNX1Q96RV3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX1Q96RV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCNX1Q96RV3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCNX1Q96RV3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PCNX1Q96RV3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PCNX1Q96RV3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PCNX1Q96RV3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PCNX1Q96RV3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PCNX1Q96RV3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PCNX1Q96RV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PCNX1Q96RV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCNX1Q96RV3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PCNX1Q96RV3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX1Q96RV3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCNX1Q96RV3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCNX1Q96RV3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNX1Q96RV3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNX1Q96RV3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNX1Q96RV3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNX1Q96RV3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX1Q96RV3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCNX1Q96RV3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNX1Q96RV3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCNX1Q96RV3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCNX1Q96RV3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCNX1Q96RV3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX1Q96RV3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX1Q96RV3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX1Q96RV3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCNX1Q96RV3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCNX1Q96RV3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCNX1Q96RV3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX1Q96RV3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCNX1Q96RV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX1Q96RV3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCNX1Q96RV3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCNX1Q96RV3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX1Q96RV3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PCNX1Q96RV3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCNX1Q96RV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCNX1Q96RV3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCNX1Q96RV3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX1Q96RV3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCNX1Q96RV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCNX1Q96RV3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX1Q96RV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX1Q96RV3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCNX1Q96RV3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCNX1Q96RV3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX1Q96RV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCNX1Q96RV3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX1Q96RV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PCNX1Q96RV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCNX1Q96RV3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCNX1Q96RV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX1Q96RV3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX1Q96RV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCNX1Q96RV3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX1Q96RV3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCNX1Q96RV3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCNX1Q96RV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX1Q96RV3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCNX1Q96RV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX1Q96RV3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCNX1Q96RV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCNX1Q96RV3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX1Q96RV3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCNX1Q96RV3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCNX1Q96RV3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PCNX1Q96RV3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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