Protein–RNA interactions for Protein: Q86U42

PABPN1, Polyadenylate-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPN1Q86U42 GOLGA8B-209ENST00000568555 2328 ntTSL 1 (best)23.59■■□□□ 1.372e-7■■■■■ 38.2
PABPN1Q86U42 CHTF18-213ENST00000498439 673 ntTSL 237.91■■■■□ 3.667e-7■■■■■ 38
PABPN1Q86U42 TMEM161A-204ENST00000587096 1065 ntTSL 537.21■■■■□ 3.552e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 HGS-212ENST00000575058 632 ntTSL 333.85■■■■□ 3.012e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 HGS-207ENST00000571885 350 ntTSL 333.66■■■□□ 2.982e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-209ENST00000587985 1754 ntTSL 533.02■■■□□ 2.882e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-208ENST00000587925 582 ntTSL 332.32■■■□□ 2.762e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.682e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.652e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-210ENST00000589448 1799 ntTSL 531.16■■■□□ 2.582e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-205ENST00000587406 1923 ntTSL 530.8■■■□□ 2.522e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.392e-10■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.123e-8■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 RAC3-204ENST00000585014 798 ntTSL 236.8■■■■□ 3.483e-8■■■■■ 37.8
PABPN1Q86U42 EMD-205ENST00000471965 800 ntTSL 242.1■■■■■ 4.331e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.61e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 EMD-203ENST00000428228 946 ntTSL 335.89■■■■□ 3.341e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.31e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 EMD-208ENST00000492448 832 ntTSL 231.11■■■□□ 2.571e-18■■■■■ 37.4
PABPN1Q86U42 MHENCR-201ENST00000411579 582 ntTSL 241.78■■■■■ 4.281e-6■■■■■ 36.9
PABPN1Q86U42 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.431e-6■■■■■ 36.9
PABPN1Q86U42 LTB4R-205ENST00000556141 797 ntTSL 345.53■■■■■ 4.887e-10■■■■■ 36.7
PABPN1Q86U42 ACADVL-220ENST00000579546 582 ntTSL 537.27■■■■□ 3.566e-9■■■■■ 36.7
PABPN1Q86U42 NCAPH2-209ENST00000522304 521 ntTSL 335.04■■■■□ 3.23e-8■■■■■ 36.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-239ENST00000585203 947 ntTSL 530.77■■■□□ 2.527e-9■■■■■ 36.4
PABPN1Q86U42 KAT2A-205ENST00000592310 596 ntTSL 317.51■□□□□ 0.391e-14■■■■■ 35.9
PABPN1Q86U42 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.29■■■■■ 5.481e-6■■■■■ 35.7
PABPN1Q86U42 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC48.39■■■■■ 5.341e-6■■■■■ 35.7
PABPN1Q86U42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.711e-6■■■■■ 35.7
PABPN1Q86U42 COL7A1-205ENST00000465238 587 ntTSL 236.31■■■■□ 3.41e-6■■■■■ 35.6
PABPN1Q86U42 COL7A1-208ENST00000470076 651 ntTSL 236.31■■■■□ 3.41e-6■■■■■ 35.6
PABPN1Q86U42 ACADVL-209ENST00000578033 562 ntTSL 234.33■■■■□ 3.094e-18■■■■■ 35.5
PABPN1Q86U42 REC8-205ENST00000559939 494 ntTSL 223.44■■□□□ 1.341e-7■■■■■ 35.4
PABPN1Q86U42 HGS-203ENST00000570652 523 ntTSL 538.14■■■■□ 3.76e-11■■■■■ 35.3
PABPN1Q86U42 RCN3-202ENST00000593483 595 ntTSL 532.24■■■□□ 2.752e-7■■■■■ 35.3
PABPN1Q86U42 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.364e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-203ENST00000577379 861 ntTSL 545.35■■■■■ 4.854e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.824e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-207ENST00000583767 894 ntTSL 338.37■■■■□ 3.734e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.624e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-209ENST00000584514 882 ntTSL 237.59■■■■□ 3.614e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-205ENST00000580090 752 ntTSL 237.08■■■■□ 3.534e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-204ENST00000579520 702 ntTSL 333.95■■■■□ 3.034e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-210ENST00000584600 730 ntTSL 232.98■■■□□ 2.874e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.34e-7■■■■■ 35.2
PABPN1Q86U42 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.62e-11■■■■■ 35.1
PABPN1Q86U42 ACADVL-236ENST00000583850 903 ntTSL 233.29■■■□□ 2.925e-9■■■■■ 35
PABPN1Q86U42 ACADVL-214ENST00000578711 1732 nt29.74■■■□□ 2.355e-9■■■■■ 35
PABPN1Q86U42 NINL-205ENST00000464285 1514 ntTSL 230.25■■■□□ 2.433e-8■■■■■ 34.7
PABPN1Q86U42 ACY1-202ENST00000464587 538 ntTSL 333.14■■■□□ 2.96e-7■■■■■ 34.5
PABPN1Q86U42 ACY1-228ENST00000638096 1466 nt30.83■■■□□ 2.536e-7■■■■■ 34.5
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PABPN1Q86U42 IRF3-224ENST00000599680 472 ntTSL 328.93■■■□□ 2.223e-9■■■■■ 34.5
PABPN1Q86U42 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 535.81■■■■□ 3.325e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-204ENST00000542255 1016 ntTSL 533.68■■■□□ 2.985e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-219ENST00000579425 1234 ntTSL 530.77■■■□□ 2.525e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.075e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 232.98■■■□□ 2.875e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.845e-9■■■■■ 34.2
PABPN1Q86U42 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.685e-9■■■■■ 34.2
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PABPN1Q86U42 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.552e-8■■■■■ 33.9
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PABPN1Q86U42 WDR90-225ENST00000553080 1941 ntTSL 227.53■■■□□ 22e-8■■■■■ 33.9
PABPN1Q86U42 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.52e-8■■■■■ 33.9
PABPN1Q86U42 WDR90-223ENST00000552728 3133 ntTSL 523.08■■□□□ 1.282e-8■■■■■ 33.9
PABPN1Q86U42 WDR90-207ENST00000547407 3847 ntTSL 218.98■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 33.9
PABPN1Q86U42 FTCD-209ENST00000483568 398 ntTSL 520.56■□□□□ 0.883e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-226ENST00000581562 571 ntTSL 346.55■■■■■ 5.041e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-217ENST00000579286 933 ntTSL 345.68■■■■■ 4.91e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-233ENST00000583312 799 ntTSL 345.68■■■■■ 4.91e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-208ENST00000577857 566 ntTSL 445.68■■■■■ 4.91e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-238ENST00000584103 555 ntTSL 444■■■■■ 4.631e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-221ENST00000579886 502 ntTSL 541.01■■■■■ 4.161e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-227ENST00000582056 738 ntTSL 240.04■■■■■ 41e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-206ENST00000577191 1212 ntTSL 239.45■■■■□ 3.911e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.385e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-207ENST00000577433 803 ntTSL 234.05■■■■□ 3.041e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-221ENST00000527540 367 ntTSL 232.5■■■□□ 2.795e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-243ENST00000532162 769 ntTSL 228.35■■■□□ 2.135e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.575e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ACADVL-228ENST00000582166 550 ntTSL 424.37■■□□□ 1.491e-8■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.035e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-207ENST00000526099 2404 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.985e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.875e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.865e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-202ENST00000524513 602 ntTSL 216.23■□□□□ 0.195e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.145e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 ST5-237ENST00000530991 3396 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.285e-9■■■■■ 33.4
PABPN1Q86U42 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC11.09□□□□□ -0.634e-21■■■■■ 33.1
PABPN1Q86U42 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.267e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.867e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.637e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-207ENST00000464728 4088 ntTSL 223.68■■□□□ 1.387e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.367e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 221.26■□□□□ 0.997e-7■■■■■ 33
PABPN1Q86U42 CHTF18-204ENST00000440239 1801 ntTSL 1 (best)44.29■■■■■ 4.681e-6■■■■■ 32.8
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