RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498439.1

CHTF18-213, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 2

Gene CHTF18, Length 673 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-213ENST00000498439 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.32■■■■■ 4.85
CHTF18-213ENST00000498439 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.72■■■■■ 4.11
CHTF18-213ENST00000498439 ABCC9O60706 1549 aa40.7■■■■■ 4.11
CHTF18-213ENST00000498439 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa38.85■■■■□ 3.81
CHTF18-213ENST00000498439 NACADO15069 1562 aa38.57■■■■□ 3.77
CHTF18-213ENST00000498439 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.45■■■■□ 3.75
CHTF18-213ENST00000498439 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.16■■■■□ 3.7
CHTF18-213ENST00000498439 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.04■■■■□ 3.68
CHTF18-213ENST00000498439 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP37.91■■■■□ 3.667e-7■■■■■ 38
CHTF18-213ENST00000498439 UNC13AQ9UPW8 1703 aa37.79■■■■□ 3.64
CHTF18-213ENST00000498439 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.51■■■■□ 3.6
CHTF18-213ENST00000498439 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CHTF18-213ENST00000498439 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.5■■■■□ 3.59
CHTF18-213ENST00000498439 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.25■■■■□ 3.55
CHTF18-213ENST00000498439 SCRIBQ14160 1630 aa36.99■■■■□ 3.51
CHTF18-213ENST00000498439 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.77■■■■□ 3.48
CHTF18-213ENST00000498439 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.73■■■■□ 3.47
CHTF18-213ENST00000498439 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
CHTF18-213ENST00000498439 NCAPD3P42695 1498 aa35.59■■■■□ 3.29
CHTF18-213ENST00000498439 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.41■■■■□ 3.26
CHTF18-213ENST00000498439 SMARCA2P51531 1590 aa35.4■■■■□ 3.26
CHTF18-213ENST00000498439 SMARCA4P51532 1647 aa35.33■■■■□ 3.25
CHTF18-213ENST00000498439 HMGXB3Q12766 1538 aa35.28■■■■□ 3.24
CHTF18-213ENST00000498439 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.28■■■■□ 3.24
CHTF18-213ENST00000498439 ERCC6Q03468 1493 aa35.28■■■■□ 3.24
CHTF18-213ENST00000498439 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
CHTF18-213ENST00000498439 CUX2O14529 1486 aa35.22■■■■□ 3.23
CHTF18-213ENST00000498439 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CHTF18-213ENST00000498439 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.03■■■■□ 3.2
CHTF18-213ENST00000498439 NESP48681 1621 aa34.88■■■■□ 3.17
CHTF18-213ENST00000498439 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.83■■■■□ 3.17
CHTF18-213ENST00000498439 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa34.81■■■■□ 3.16
CHTF18-213ENST00000498439 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.68■■■■□ 3.14
CHTF18-213ENST00000498439 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.54■■■■□ 3.12
CHTF18-213ENST00000498439 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.52■■■■□ 3.12
CHTF18-213ENST00000498439 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.47■■■■□ 3.11
CHTF18-213ENST00000498439 WIZO95785 1651 aa34.43■■■■□ 3.1
CHTF18-213ENST00000498439 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.27■■■■□ 3.08
CHTF18-213ENST00000498439 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
CHTF18-213ENST00000498439 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.14■■■■□ 3.06
CHTF18-213ENST00000498439 WDR62O43379 1518 aa34.14■■■■□ 3.06
CHTF18-213ENST00000498439 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.07■■■■□ 3.05
CHTF18-213ENST00000498439 CFTRP13569 1480 aa34.07■■■■□ 3.04
CHTF18-213ENST00000498439 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP34.05■■■■□ 3.04
CHTF18-213ENST00000498439 OSCARQ8IYS5 282 aa33.73■■■□□ 2.99
CHTF18-213ENST00000498439 PRDM2Q13029 1718 aa33.72■■■□□ 2.99
CHTF18-213ENST00000498439 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
CHTF18-213ENST00000498439 TRIM41Q8WV44 630 aa33.69■■■□□ 2.98
CHTF18-213ENST00000498439 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.66■■■□□ 2.98
CHTF18-213ENST00000498439 ABCC8Q09428 1581 aa33.53■■■□□ 2.96
CHTF18-213ENST00000498439 IFT140Q96RY7 1462 aa33.5■■■□□ 2.95
CHTF18-213ENST00000498439 TOPBP1Q92547 1522 aa33.4■■■□□ 2.94
CHTF18-213ENST00000498439 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.29■■■□□ 2.92
CHTF18-213ENST00000498439 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
CHTF18-213ENST00000498439 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.13■■■□□ 2.89
CHTF18-213ENST00000498439 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.06■■■□□ 2.88
CHTF18-213ENST00000498439 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.06■■■□□ 2.88
CHTF18-213ENST00000498439 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.06■■■□□ 2.88
CHTF18-213ENST00000498439 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.06■■■□□ 2.88
CHTF18-213ENST00000498439 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.05■■■□□ 2.882e-8■□□□□ 8.7
CHTF18-213ENST00000498439 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.04■■■□□ 2.88
CHTF18-213ENST00000498439 FBLN2P98095 1184 aa33■■■□□ 2.87
CHTF18-213ENST00000498439 SOGA1O94964 1423 aa33■■■□□ 2.87
CHTF18-213ENST00000498439 ARHGEF11O15085 1522 aa32.97■■■□□ 2.87
CHTF18-213ENST00000498439 CHD1O14646 1710 aa32.9■■■□□ 2.86
CHTF18-213ENST00000498439 WDR97A6NE52 1622 aa32.89■■■□□ 2.86
CHTF18-213ENST00000498439 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.89■■■□□ 2.86
CHTF18-213ENST00000498439 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.86■■■□□ 2.85
CHTF18-213ENST00000498439 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.86■■■□□ 2.85
CHTF18-213ENST00000498439 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.83■■■□□ 2.85
CHTF18-213ENST00000498439 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.8■■■□□ 2.84
CHTF18-213ENST00000498439 CUX1P39880 1505 aa32.73■■■□□ 2.83
CHTF18-213ENST00000498439 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
CHTF18-213ENST00000498439 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.71■■■□□ 2.83
CHTF18-213ENST00000498439 GRIN2BQ13224 1484 aa32.7■■■□□ 2.83
CHTF18-213ENST00000498439 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.7■■■□□ 2.83
CHTF18-213ENST00000498439 SYNJ1O43426 1573 aa32.64■■■□□ 2.82
CHTF18-213ENST00000498439 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.59■■■□□ 2.81
CHTF18-213ENST00000498439 ARAP1Q96P48 1450 aa32.59■■■□□ 2.81
CHTF18-213ENST00000498439 SYNJ2O15056 1496 aa32.58■■■□□ 2.81
CHTF18-213ENST00000498439 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.56■■■□□ 2.8
CHTF18-213ENST00000498439 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.51■■■□□ 2.79
CHTF18-213ENST00000498439 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.5■■■□□ 2.79
CHTF18-213ENST00000498439 PBRM1Q86U86 1689 aa32.47■■■□□ 2.79
CHTF18-213ENST00000498439 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.43■■■□□ 2.78
CHTF18-213ENST00000498439 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.37■■■□□ 2.77
CHTF18-213ENST00000498439 TOP2BQ02880 1626 aa32.27■■■□□ 2.76
CHTF18-213ENST00000498439 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.26■■■□□ 2.75
CHTF18-213ENST00000498439 GRIN2AQ12879 1464 aa32.23■■■□□ 2.75
CHTF18-213ENST00000498439 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.17■■■□□ 2.74
CHTF18-213ENST00000498439 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.13■■■□□ 2.73
CHTF18-213ENST00000498439 ADAMTS12P58397 1594 aa32.12■■■□□ 2.73
CHTF18-213ENST00000498439 NUP160Q12769 1436 aa32.1■■■□□ 2.73
CHTF18-213ENST00000498439 CEP170Q5SW79 1584 aa32.02■■■□□ 2.72
CHTF18-213ENST00000498439 SHROOM2Q13796 1616 aa31.94■■■□□ 2.7
CHTF18-213ENST00000498439 JPH4Q96JJ6 628 aa31.92■■■□□ 2.7
CHTF18-213ENST00000498439 ERCC6L2Q5T890 1561 aa31.9■■■□□ 2.7
CHTF18-213ENST00000498439 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.85■■■□□ 2.69
CHTF18-213ENST00000498439 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP31.79■■■□□ 2.68
CHTF18-213ENST00000498439 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.6 ms