Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHDQ02161 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RHDQ02161 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RHDQ02161 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RHDQ02161 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RHDQ02161 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHDQ02161 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RHDQ02161 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RHDQ02161 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RHDQ02161 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RHDQ02161 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RHDQ02161 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RHDQ02161 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHDQ02161 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RHDQ02161 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RHDQ02161 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RHDQ02161 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RHDQ02161 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RHDQ02161 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHDQ02161 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RHDQ02161 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RHDQ02161 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RHDQ02161 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RHDQ02161 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RHDQ02161 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RHDQ02161 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RHDQ02161 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RHDQ02161 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHDQ02161 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RHDQ02161 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RHDQ02161 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHDQ02161 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHDQ02161 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHDQ02161 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHDQ02161 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RHDQ02161 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHDQ02161 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHDQ02161 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHDQ02161 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RHDQ02161 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHDQ02161 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHDQ02161 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RHDQ02161 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHDQ02161 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHDQ02161 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RHDQ02161 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHDQ02161 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RHDQ02161 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHDQ02161 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHDQ02161 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RHDQ02161 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHDQ02161 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RHDQ02161 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RHDQ02161 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHDQ02161 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RHDQ02161 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHDQ02161 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RHDQ02161 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHDQ02161 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHDQ02161 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHDQ02161 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHDQ02161 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RHDQ02161 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RHDQ02161 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RHDQ02161 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHDQ02161 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHDQ02161 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RHDQ02161 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RHDQ02161 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RHDQ02161 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RHDQ02161 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RHDQ02161 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RHDQ02161 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHDQ02161 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RHDQ02161 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RHDQ02161 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RHDQ02161 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RHDQ02161 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RHDQ02161 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHDQ02161 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHDQ02161 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHDQ02161 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHDQ02161 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RHDQ02161 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RHDQ02161 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHDQ02161 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RHDQ02161 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RHDQ02161 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RHDQ02161 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHDQ02161 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RHDQ02161 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHDQ02161 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHDQ02161 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RHDQ02161 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RHDQ02161 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RHDQ02161 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHDQ02161 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RHDQ02161 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RHDQ02161 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RHDQ02161 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms